Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms