Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itga4Q00651 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms