Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms