Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Bop1P97452 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Bop1P97452 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Bop1P97452 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Bop1P97452 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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