Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms