Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lim2P56563 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms