Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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