Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms