Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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VdrP48281 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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VdrP48281 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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VdrP48281 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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VdrP48281 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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VdrP48281 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VdrP48281 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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