Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms