Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf1P39428 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms