Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rab5cP35278 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rab5cP35278 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rab5cP35278 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rab5cP35278 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rab5cP35278 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rab5cP35278 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rab5cP35278 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rab5cP35278 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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