Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SsbP32067 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SsbP32067 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SsbP32067 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SsbP32067 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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