Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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