Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms