Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZfaP23607 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms