Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcer1aP20489 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms