Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsdP18242 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms