Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms