Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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