Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me1P06801 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me1P06801 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms