Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P04212 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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