Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BlmO88700 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BlmO88700 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BlmO88700 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BlmO88700 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms