Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChkaO54804 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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