Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CrxO54751 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrxO54751 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrxO54751 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrxO54751 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrxO54751 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrxO54751 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrxO54751 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrxO54751 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrxO54751 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrxO54751 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms