Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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FxnO35943 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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