Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Prrt1O35449 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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