Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f3O35261 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms