Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Degs1O09005 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms