Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm2056J3QQ02 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm2056J3QQ02 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm2056J3QQ02 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm2056J3QQ02 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm2056J3QQ02 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm2056J3QQ02 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm2056J3QQ02 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm2056J3QQ02 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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