Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm3336J3QMQ6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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