Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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