Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms