Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm28048F7BCN0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm28048F7BCN0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm28048F7BCN0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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