Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D430041D05RikF6ZGR6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms