Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms