Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc17E9PVB5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc17E9PVB5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms