Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms