Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms