Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms