Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms