Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms