Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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