Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms