Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms