Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms