Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms