Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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