Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mbd1Q9Z2E2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mbd1Q9Z2E2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mbd1Q9Z2E2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mbd1Q9Z2E2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mbd1Q9Z2E2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mbd1Q9Z2E2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mbd1Q9Z2E2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms