Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms